Innovation

Smart Genomics Service For Everyone

基因體分析者作業系統

Genomic Analyst Operation System-GAOS

基因體分析需要一系列軟體執行資料的數據解析、註解、格式轉換、去除雜訊及篩選工作,每一種流程又會使用不同的軟體,這些軟體安裝需求不一,甚至彼此相互衝突。如何安裝軟體常是有想成為分析者的第一道障礙。

陽明交通大學生資團隊累積二十年無數次基因體數據分析相容測試及實作經驗,不斷校調及最佳化,建立一套輕量化的生物資訊分析環境(基因體分析者作業系統,GAOS),本公司獨家取得GAOS授權,搭載在立方工作站(Cubic Station)中。這套系統可以在小型工作站上運行原本只能在大型運算伺服器執行的基因體分析,並且可以執行大部份常見的DNA、RNA、微生物的基因分析流程。並且提供了方便的視覺化操作介面,是分析者進入基因體學最佳敲門磚。

智慧分析排程

Smart Task Management

基因體分析步驟繁瑣,計算量又極高動輒以小時計,坐在電腦前等浪費生命,離開又怕結束閒置浪費寶貴的計算資源。

立方工作站搭載智慧排程系統,解決大量工作排程的問題,每個分析案以樣品為單位串接所有步驟,啟動後依序執行,數個分析案同時啟動會進入排程系統,使用者可以輕鬆以拖拉的方式調整執行順序。遇到錯誤時會自動中止,通知管理者,並繼續執行下一個分析案件,讓操作者不浪費一絲計算資源。

魔法卷軸

Magical Scroll

建立基因體分析流程包括了執行資料分析的程式碼撰寫、參數的設定、判斷邏輯及資料輸出入介面等,這些複雜設定及安裝程序使得建置分析流程成本高昂。透過陽明交通大學授權的魔法卷軸技術,把生物資訊分析所需的分析程序、判斷邏輯、操作介面、結果輸出全部封裝在單一檔案中,讓分析流程的轉移及安裝能一鍵完成,也容易進行內容的加密進行授權管理,這兩種特性促使生物資訊知識商業化的可能。

雙盲比對分析

Double-blind Comparison

維護個人資料的安全性及擁有權是陽明立方公司堅持的原則。而促進個人資料最大化的利用則是致力的目標。魔法卷軸技術提供了對商業邏輯保護方案,雙盲比對則提供了對個人隱私資料的保護機制。雙盲比對可以在商業邏輯及個人資料不解密的狀態下進行基因序列比對,同時保護商業祕密及個人隱私,又促進基因資料及知識的運用。

基因空間引索系統

Variant Index System

描述基因變異位點會因其參考的標準基因體座標版本、變異描述的語法有所不同,造成了基因比對、註解時的錯誤,陽明立方公司利用密碼學的原理,在無限大的數學空間中找到一個基因變異位點唯一的數學座標,並持續有系統把現有的知識定位這個數學空間,大幅縮降了資料引索的速度,同時也讓基因變異位點資料在傳輸的過程中,無法被破譯。