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泛用菌相檢測
豐富的資料庫
细菌、病毒、真菌、原核生物…
Kraken2是一種廣泛應用於總體基因體學(Metagenomics)領域的物種註釋工具,它的主要作用是將總體基因體定序資料中的DNA序列比對到一個預定義的參考資料庫中,以確定這些序列來自哪些物種。


泛用菌相檢測

技術來源
kraken2
輸入資料
Fastq:Single-Read Fastq, Paired-End Fastq
輸出資料
HTML報告
- 序列QC報告
- 微生物個分類層級組成分析
分析中繼檔
- k2
運算時間
5min
資料庫
(每年更新一次)
分類資料庫(Plus-PF)
- 可分類超過四萬種生物,包括 Archaea, Bacteria, Viral, Plasmid, Human, Protozoa, Fungi and Plant.
結果判斷
參考型報告,預設無結果判斷區塊。
可依照需求新增結果判斷區塊及客製化設定判斷條件。
客制化服務
報告說明內文,菌種清單,客制註解資料庫、判斷邏輯
預載視覺工具
Pavin
