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泛用菌相檢測

豐富的資料庫
细菌、病毒、真菌、原核生物…

Kraken2是一種廣泛應用於總體基因體學(Metagenomics)領域的物種註釋工具,它的主要作用是將總體基因體定序資料中的DNA序列比對到一個預定義的參考資料庫中,以確定這些序列來自哪些物種。

泛用菌相檢測

技術來源

kraken2

輸入資料

Fastq:Single-Read Fastq, Paired-End Fastq

輸出資料

HTML報告

  • 序列QC報告
  • 微生物個分類層級組成分析

分析中繼檔

  • k2

運算時間

5min

資料庫
(每年更新一次)

分類資料庫(Plus-PF)

  • 可分類超過四萬種生物,包括 Archaea, Bacteria, Viral, Plasmid, Human, Protozoa, Fungi and Plant.

結果判斷

參考型報告,預設結果判斷區塊。
可依照需求新增結果判斷區塊及客製化設定判斷條件。

客制化服務

報告說明內文,菌種清單,客制註解資料庫、判斷邏輯

預載視覺工具

Pavin